Jean-Claude Fournier est originaire de Saint-Quay Portrieux où il a vécu son enfance et où il a réinstallé son studio depuis 1987. Études secondaires au Lycée Henri Avril de Lamballe puis trois années d'études supérieures à Paris en vue d'obtenir le professorat de dessin. Simultanément, il suit les cours de l'École d'Art Dramatique Ch. Dullin.
La bande dessinée lui apparaît comme la synthèse de ses deux passions, le dessin et le théâtre, et il crée le personnage de Bizu pour le journal de Spirou (1967).
Il se voit très vite confier par l'éditeur Dupuis le scénario et le dessin des aventures de Spirou et Fantasio qu'il animera de 1968 à 1981.
Il abandonne Spirou en 1981, suite à des désaccords avec l'éditeur qui est propriétaire des personnages, et reprend Bizu dont il publiera deux albums aux éditions Fleurus. Il revient enfin aux éditions Dupuis avec quatre albums de Bizu. 1996 voit la sortie dans le journal de Spirou d'une nouvelle série, Les Crannibales, que Fournier réalise sur des scénarii de Zidrou.
Parallèlement à son activité d'auteur de bandes dessinées, Fournier a été l'illustrateur, de 1972 à 1986, des pages d'été du quotidien Ouest-France et surtout du Grand Concours annuel du même journal pour lequel il a créé le personnage de l'Inspecteur Limier.
En 2006 il a commencé la réalisation du tome 1 des Chevaux du vent sur scénario de Lax pour la collection Aire Libre chez Dupuis.
Enfin, Fournier a cofondé en 1992, Quai des bulles, le grand festival BD de Saint-Malo, dont il a été membre du Comité d'Organisation et du Conseil d'Administration jusqu'à l'édition d’octobre 2009.